Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms