Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms