Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ALDH7A1-228ENST00000636886 2321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms