Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSNAXIP1Q2TAA8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms