Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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