Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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