Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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