Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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