Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms