Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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