Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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