Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RLFQ13129 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RLFQ13129 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms