Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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GRIK2Q13002 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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GRIK2Q13002 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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