Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP3Q12983 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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