Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms