Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL512274.1-201ENST00000562471 2027 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NDE1P2-201ENST00000605569 1105 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP000345.2-201ENST00000608615 1081 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms