Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms