Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IQGAP1P46940 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms