Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms