Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN3P26045 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms