Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME1P15531 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME1P15531 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME1P15531 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME1P15531 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NME1P15531 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NME1P15531 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms