Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM10L1P0DMW3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM10L1P0DMW3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms