Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEP290O15078 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEP290O15078 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CEP290O15078 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms