Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L9A6NEM1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms