Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF6Q9Y4K3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms