Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms