Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms