Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TMEM208Q9BTX3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms