Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms