Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms