Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms