Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC37Q16543 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms