Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms