Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.1 ms