Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRRQ15256 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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