Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms