Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCOA4Q13772 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms