Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMC2Q13753 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms