Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 GSTZ1-211ENST00000554381 729 ntTSL 318.98■□□□□ 0.633e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.63e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-209ENST00000568513 837 ntTSL 318.72■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-209ENST00000564311 870 ntTSL 518.54■□□□□ 0.563e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.563e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.562e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CHD3-205ENST00000449744 880 ntTSL 218.51■□□□□ 0.556e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 LDOC1-202ENST00000460721 784 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-207ENST00000562690 582 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.436e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DTYMK-205ENST00000445261 518 ntTSL 517.41■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-208ENST00000590493 801 ntTSL 317.33■□□□□ 0.362e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.313e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.281e-36■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-202ENST00000561841 1052 ntTSL 516.81■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM50A-205ENST00000491936 965 ntTSL 1 (best)16.79■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DNAJC4-210ENST00000543685 265 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTS-209ENST00000531673 986 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-206ENST00000588983 711 ntTSL 316.44■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 216.21■□□□□ 0.196e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRM2-205ENST00000486040 2511 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ERGIC3-213ENST00000475211 514 ntTSL 316.17■□□□□ 0.183e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DNAJC4-211ENST00000543791 489 ntTSL 315.75■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CAMK2G-208ENST00000433289 1618 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.116e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 EXOSC1-209ENST00000477692 480 ntTSL 515.54■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 YIPF2-210ENST00000591872 430 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTRHD1-203ENST00000474668 624 ntTSL 215.19■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MXD1-204ENST00000435990 860 ntTSL 315.13■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-214ENST00000555208 2338 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTS-207ENST00000528679 846 ntTSL 214.66□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.073e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 C12orf45-202ENST00000547750 1279 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.163e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.193e-8■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 PTRHD1-204ENST00000480190 865 ntTSL 213.59□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 EXOSC1-201ENST00000370884 536 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HBD-201ENST00000292901 486 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.253e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-36■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PRIM1-206ENST00000550770 1008 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GRSF1-207ENST00000514161 1765 ntTSL 213.3□□□□□ -0.281e-13■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 C12orf45-206ENST00000637147 1906 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.36e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DTYMK-203ENST00000420144 575 ntTSL 513.19□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-225ENST00000569709 574 ntTSL 413.1□□□□□ -0.313e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.336e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TRIAP1-201ENST00000302432 1153 ntTSL 212.92□□□□□ -0.343e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.356e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-211ENST00000564764 639 ntTSL 312.83□□□□□ -0.363e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-36■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MPI-202ENST00000352410 5828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC12A4-219ENST00000576616 3768 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.416e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PRIM1-204ENST00000549549 456 ntTSL 312.48□□□□□ -0.413e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRPS5-203ENST00000461916 793 ntTSL 212.08□□□□□ -0.489e-12■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC12A4-206ENST00000570802 3761 ntTSL 212.01□□□□□ -0.496e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TROAP-206ENST00000547923 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.53e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.526e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-203ENST00000361389 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.533e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.546e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.546e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MPI-214ENST00000566556 2795 nt11.62□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MPI-201ENST00000323744 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM99-202ENST00000436612 854 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.55□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■□□□ 11.4
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