Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms