Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms