Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms