Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms