Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms