Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPS1L1P21108 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms