Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB1P16220 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB1P16220 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB1P16220 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms