Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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