Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTHFD1P11586 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms