Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms