Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA3O75145 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms